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変異型クロイツフェルト・ヤコブ病、医原性クロイツフェルト・ヤコブ病の潜伏期間は約10年とされており、ニューギニア島のクールーでは50年を越すものも報告されています。

このクロイツフェルト・ヤコブ病では、行動異常、性格変化や認知症症状、視覚異常、歩行障害などで発症します。数カ月以内に、記憶力低下、計算力低下、失見当識、無関心、不安、不眠、失認、幻覚など認知症症状が急速に進行し、筋硬直、深部腱（けん）反射高進、病的反射陽性が認められます。

さらに起立、歩行が不能になり、発症より３〜７カ月で自発運動はほとんどなくなり、寝たきりの状態、すなわち無動性無言状態となります。１〜２年以内に全身衰弱、肺炎、呼吸まひなどで死亡します。

変異型クロイツフェルト・ヤコブ病の場合は、20歳代の若年に好発します。不安、感覚障害で初発し経過が長いのが特徴とされ、無動性無言状態に陥るのに１年を要します。この理由は、異種の病原体が人間への種差を乗り越え複製するのに、より長い時間がかかっているためであると推測することができます。

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