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治療では普通、最初の２カ月間はリファンピシン、ヒドラジド、ピラジナミド、エタンブトールまたはストレプトマイシンの４種類の薬を使い、その後はリファンピシンとヒドラジドの２種類、または、エタンブトールを加えた３種類の薬にし、合計６カ月で治療を完了します。

ピラジナミドを初め２カ月間使うと殺菌力が強く有効ですが、80歳以上の高齢者や肝機能障害のある人には使えません。この場合には、治療は６カ月では短すぎ、最も短くて９カ月の治療が必要です。

たんの中に結核菌が出ていず、結核菌が増殖する病巣である空洞が胸部Ｘ線検査でも見えない軽症の場合にも、同じ治療が進められます。最近はヒドラジドの耐性が増えているので、初めから２つの薬だけで治療することは進められず、少なくとも最初は３つの薬で治療することが必要です。