シックハウス症候群の大半のケースでは、何らかの中枢神経系あるいは自律神経系の機能障害が認められるため、診断のための検査では神経眼科検査が有用。神経眼科検査では、目の動きが滑らかかどうかを評価する眼球電位図（ＥＯＧ）、目の感度を評価する視覚コントラスト感度検査（視覚空間周波数特性検査）、光に対する瞳（ひとみ）の反応を評価する電子瞳孔（どうこう）計による瞳孔検査などがあり、シックハウス症候群では、異常値を示すケースが多いことがわかっています。

例えば、目の動きを調べる眼球電位図（ＥＯＧ）検査では、程度に差はあるもののシックハウス症候群発症者の85パーセント以上に滑動性追従運動異常が認められます。また、開眼時、閉眼時重心動揺検査でも、高い頻度で異常値を認めます。ただ、これらの検査は、シックハウス症候群発症者にみられる一般的特徴を調べるもので、確定診断法としてのツールにはなりません。